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Die Kombiversion des Fabia stellt die Erweiterung dieser Skoda Baureihe dar. Die Produktionszeit liegt, gleich der Fabia Limousine, zwischen den Jahren 1999 und 2007. Eine spezielle Version des Kombimodells ist der so genannte Fabia Praktik, ein Lieferwagen für den Stadtverkehr. Die gesamte Fabia Baureihe erhielt im Jahr 2004 ein Facelift, was zu neuen Klarglasscheinwerfern und zu einem neuen Kühlergrill führte. Die Motoren für den Kombi sind Benziner mit 1,4 Liter (44 kW) bis 2,0 Liter (85 kW) und Diesel mit 1,4 Liter (51 kW) bis hin zu 1,9 Liter (74 kW).
Teile der Innenverkleidung wie Lüfterdüsen, Handschuhfach und A Säulen-Verkleidung lösen sich und machen unangenehme Geräusche. Die Bremsscheiben laufen sich so stark ein, das ein enormer Grad am Rand der Scheiben entsteht. Dazu fressen sich die Bremsbeläge an diesem Grad kaputt. Daher ist die Kontrolle bzw. das rechtzeitige Wechseln der Fabia Bremssätze eine notwendige Maßnahme. Sind Schlaggeräusche beim überfahren von Bordsteinkanten und Bodenwellen zu hören, sollte man umgehend die Gelenke der Stabilisatoren überprüfen. Auch defekte Querlenker können die Ursache sein. Probleme mit der Klimaanlage und dem Temperatursensor sind kein seltenes Leiden des Fabia. Was sonst noch so anfällt sind alle typischen Verschleißteile wie Keilriemen, Zahnriemen, Zylinderkopfdichtung, Wasserpumpe, Kupplungsscheibe, Radlager, Reifen, Stoßfedern und Stoßdämpfer, Auspuff-Endtopf, Zündkerzen, Scheinwerferbirnen usw..
Skoda ist in erster Linie dafür Verantwortlich ein flächendeckendes Angebot an Ersatzteilen für den Fabia bereit zu stellen. Um ein flächendeckendes Angebot an Auto-Ersatzteilen bereitzustellen, ist ein gewisser Aufwand erforderlich. Deshalb sind auch die original Ersatzteile vom Hersteller sehr teuer. Günstigere Angebote findet man auf dem Autoteile Marktplatz daparto. Hier bekommt man die passenden Angebote für den Fabia von Hella, SKF, Pieburg, Monroe, Bosch usw..